Cucurpe se ubica en el centro-norte de Sonora. El jesuita Marcos del Río fundó ahí la misión de Los Santos Reyes de Cucurpe en 1647, dentro de la red de misiones que la Compañía de Jesús estableció en la región durante el siglo XVII.

En 1813, al amparo de la Constitución de Cádiz, Cucurpe fue decretado municipio por primera vez. La categoría le duró poco: en 1814 el rey Fernando VII restableció el absolutismo y revocó la Constitución, y Cucurpe la perdió.

Un siglo después, en 1930, el territorio se incorporó al municipio de Magdalena. Se separó de nuevo el 6 de junio de 1932, fecha en que Cucurpe se erigió por segunda vez como municipio libre.